可在不使用任何化學藥品的情況下殺滅水中的細菌、病毒以及其他致病體，紫外線技術殺菌的機理是基于紫外光對DNA 蛋白質的損傷。國際上九十年代興起的新一代消毒技術。由于其率、光譜性、低成本、短命命、大水量、無污染等其他消毒手段無法比較的優點，目前已在西方發達國家逐漸成為一種主流消毒手段，但目前國內將紫外線技術應用于飲用水處置工藝滅藻除藻的研究尚未見報道。
不只能有效的發揮直接殺藻抑藻的作用，采用管道式紫外線消毒器或者過流式紫外線消毒器的紫外線除藻技術。而且可以在不加任何化學藥劑的前提下誘發出活性氧和其他各種自由基，削減藻類的光合作用，發生間接的殺藻抑藻效應，并且這種效應具有一定的耐久性。這一技術設計的紫外線殺菌器新工藝能達到簡化水處理工藝、降低飲用水本錢，減少因激進工藝中氯使用而帶來的有機氯等二次污染的問題。
除藻率有一定程度的降低。紫外光在水中的傳達是一個復雜的過程，紫外光的除藻效率和水的濁度有關聯。隨著濁度的增加。不只有反射，而且有散射和衰減。水中的懸浮物越多，對紫外光的反射和吸收越厲害，而且懸浮物的顆粒直徑越大，對紫外光的吸收越多，紫外光在水中的衰減越厲害。因此，濁度高對紫外線殺菌器進行藻類的去除是有利的 藻類的細胞壁或者細胞質更能在紫外光的作用下分解乃至溶融。即藻類易于生長的夏秋季節有利于用紫外光除藻，水溫升高對于藻類的去除是有利的可能的原因是由于水中水溫的升高。而在藻類不易于生長的冬季，藻類不太容易為紫外光去除，就需要加大紫外線殺菌器的功率。
