自動進樣器在生化分析儀器，色譜分析儀器中有著廣泛應用，它的運行可靠性和性直接影響著分析結果。液相色譜系統大多使用自動進樣器引入樣品，正確使用自動進樣器是保證液相色譜系統分離度的基本條件，用自動進樣器注入適當體積的標準樣品可為峰高和峰面積的測量提供小于1%的標準偏差。對于液相色譜而言，無論是手動進樣器或是自動進樣器都是用六通閥進樣的，只是自動進樣的較手動進樣器的死體積較大，多了計量泵和一部分聯接管線。自動進樣器可以減少體力勞動，增加樣品處理量，提高日常工作精度。
自動進樣器是一個自動進樣系統，標準模式下多可以進120個樣品，它可以作為一個獨立系統獨自使用，也可以組成一個由計算機控制的系統聯合使用。通過不同菜單，可以對單個應用的分析程序隨意改動。對于固定體積進樣而言，樣品的體積由內置的定量環決定，定量環的體積很容易更換。在步進電機驅動的注射器的推進下，定量環由預先選定體積的樣品沖洗，轉動進樣閥后，只有樣品留在樣品環中，進而被沖進色譜柱中。一段由程序設定體積的樣品由進樣針注入系統，在注射器和進樣針之間安裝著轉移毛細管，此部分可以在進樣之前盛裝量好的樣品。這樣就可以使樣品不至于進到注射器中，從而避免污染。為了把一定量體積的樣品送入自動進樣器中，進樣針放下針頭，插入進樣口內，然后在注射器的推進下將樣品注入定量環中，由程序設定的一段流動相被吸入到注射器中，這樣可以保證樣品能夠被送入定量環中，由于這段流動相的作用，樣品會毫無損失的進入樣品環。這段流動相停留在進樣口和進樣環之間的毛細管中，為了避免樣品和洗脫液混合，由程序設置的一段空氣會使兩部分分開。
