注射水制備系統是通過符合*標準的飲用水制備，或者通過純化水蒸餾制備，蒸餾設備接觸水的材質是中性玻璃、石英或合適的金屬，裝有有效預防液滴夾帶的設備。工作原理是讓經充分預熱的純化水通過多級蒸發和冷凝，排除不凝性氣體和雜質，從而獲得高純度的注射用水。
注射水制備系統通常由多個蒸發換熱器、分離裝置、預熱器、兩個冷凝器、閥門、儀表和控制部分等組成。為防止系統發生交叉污染，多效蒸餾水機的效蒸發器一、全部的預熱器和冷凝器均需采用雙端板管式設計。
注射水制備系統為原水在二效冷凝器被含純蒸汽及蒸餾水的汽-液混合體加熱，進入各效預熱器被二次蒸汽及蒸餾水加熱，然后在效柱蒸發器一頂部經分配裝置井去除不凝性氣體，均勻地分布進入蒸發列管，在蒸發列管內形成均勻的液膜，同列管外壁流動的工業蒸汽進行熱交換，迅速蒸發成為蒸汽，在壓力差的作用下往柱體下部運動，未被蒸發的原水被輸送到下一效，作為次效蒸發器的原水，以后各效與此類似，未被蒸發的進入下一效，直到一效仍未被蒸發的液體將作為廢水排放。原水被蒸發為純蒸汽，繼續在蒸發器底部的汽-液分離裝置進入純蒸汽管路作為下一效的熱源，蒸汽在下一效被吸收熱量后凝結成注射用水，各效過程與此相似。注射用水和純蒸汽混合物經過第二級冷卻（純化水為冷介質）和冷卻（冷卻水為冷介質）后，成為設定溫度的注射用水，經電導率儀在線檢測合格的蒸餾水作為注射用水輸出，不合格的蒸餾水將被自動排放。
