純化水設備的RO反滲透技術是濾除重金屬非常有效的處理技術。重金屬是指比重大于5的金屬(一般指密度大于4.5克每立方厘米的金屬)，重金屬不能被生物降解，相反卻能在食物鏈的生物放大作用下，成千百倍地富集，然后進入人體。
但是，水中重金屬含量超標對導致反滲透系統膜很快被污染，這會大大影響膜的使用壽命。在純水項目中，經常會接觸到的重金屬離子有Cu，Fe，Mn，Co，Cr等。常見的有亞鐵離子(Fe2+)和錳離子(Mn2+)，這些離子呈亞鐵離子的形態游離于水體中，當作為水源被抽到地面上與空氣中的氧氣相遇時、亞鐵離子(Fe2+)和錳離子(Mn2+)就會轉化為三價鐵離子(Fe3+)和錳離子(Mn3+)，形成非常難溶的鐵、錳氫氧化物膠體，此類水體流經RO膜面時易超過其飽和極限而沉積于RO膜表面，對膜體形成不可逆轉的污堵。重金屬除了對純化水設備反滲透膜系統造成污堵，反滲透膜元件氧化等破壞外，還會造成阻垢劑的中毒失效，間接引發膜系統的結垢等故障發生。
高濃度的重金屬離子廢水在進行純化水處理前可行化學沉淀，降低重金屬離子濃度。
